מנהג הספרדים להתחיל סליחות מתחילת אלול, והאשכנזים נוהגים לומר באופן קבוע במוצ"ש הקרוב לר"ה בתנאי שיש ד' ימים לפני ר"ה. בקרבן עולה יש לבקר אותו ד' ימים לפני שמקריבים אותו, ולכן אם יש ד' ימים לפני ר"ה מתחילים במוצ"ש אחרת, מתחילים במוצ"ש לפני כן.
א. הטוב ביותר לומר סליחות באשמורת הבוקר שהוא זמן של רחמים. ב. עדיפות שניה לומר בחצות הלילה, ואין לומר י"ג מידות לפני חצות ובמיוחד בספרי המקובלים בשו"ת הרמ"ז ובשע"ת כתב שמי שיאמר לפני חצות הוא מקצץ בנטיעות. ג. עדיפות שלישית לומר סליחות ביום לפני מנחה. ד. הרב פיינשטיין אומר שניתן לומר סליחות לפני חצות הלילה, אך המקובלים כתבו דברים קשים כנגד זה, ויש ספרים שנכתב בהם שאדם ידיר רגליו משם.
יש לציין שי"ג מידות ובפרט בארמית אין לאומרם ביחיד. יכול להרהר את הי"ג מידות בליבו או שיאמרם בטעמי המקרא, החידוש הגדול שאפשר להפסיד ב'ונקה'. יש עוד כמה פסוקים שאומרים חלקי פסוקים כמו שויתי ה' לנגדי תמיד, על כן ברך ה' ויקדשו, כי אתה ה' מחסי. יש מקום להקל במיוחד אם הטעם שמתחתיו הוא אתנחתא או שזה מקובע במטבע הברכה.